生物有機(jī)肥是有機(jī)類肥料中的高端產(chǎn)品， 在我國(guó)綠色農(nóng)業(yè)發(fā)展中不可或缺。它是將特定功能微生物與主要以動(dòng)植物殘?bào)w （如畜禽糞便、 農(nóng)作物秸稈等）為來源并經(jīng)無害化處理、 腐熟的有機(jī)物料復(fù)合而成的一類兼具微生物肥料和有機(jī)肥效應(yīng)的肥料。與傳統(tǒng)有機(jī)肥不同， 生物有機(jī)肥是含有特定功能微生物活體的制品， 除具有有機(jī)肥效應(yīng)外， 還能通過其所含微生物的生命活動(dòng)， 增加植物養(yǎng)分的供應(yīng)量或促進(jìn)植物生長(zhǎng)， 提高產(chǎn)量， 改善農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)及農(nóng)業(yè)生態(tài)環(huán)境， 因此已廣泛應(yīng)用于我國(guó)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。

生物有機(jī)肥產(chǎn)業(yè)迅猛發(fā)展的同時(shí)， 也暴露出一些安全隱患。除了產(chǎn)品原料和輔料中存在的重金屬、 抗生素、 有毒有害物質(zhì)等潛在污染物外，生產(chǎn)菌種的生物安全也不容忽視。菌種作為微生物肥料產(chǎn)品核心參與者和功能主導(dǎo)者，安全性是產(chǎn)品質(zhì)量安全的首要保障。近年來，隨著生物有機(jī)肥產(chǎn)業(yè)的不斷發(fā)展，生產(chǎn)用菌種范圍不斷擴(kuò)大，種類日益增加， 目前使用的菌種涵蓋了細(xì)菌、 真菌、 放線菌等超過 70 種，其不安全因素也逐漸擴(kuò)大。實(shí)踐中不少生產(chǎn)用菌種分類地位不明確， 甚至混亂， 難以從源頭上進(jìn)行安全風(fēng)險(xiǎn)的初步識(shí)別。

自農(nóng)業(yè)農(nóng)村部對(duì)生物有機(jī)肥產(chǎn)品實(shí)行登記管理以來， 截至 2019 年 6 月共登記產(chǎn)品 1 872 個(gè)， 其中， 單一菌種生物有機(jī)肥產(chǎn)品 1 006 個(gè)， 兩種菌種復(fù)合產(chǎn)品 716 個(gè)， 3 種菌種復(fù)合產(chǎn)品 121 個(gè)， 4 種及 4 種以上菌種復(fù)合產(chǎn)品 19 個(gè)。產(chǎn)品中所使用的菌種已涵蓋細(xì)菌、 真菌、 放線菌等 72 種， 使用菌種的范圍還在不斷擴(kuò)大。主要生產(chǎn)菌種使用頻次見表 1 ， 可以看出， 目前生物有機(jī)肥產(chǎn)品使用最多的是枯草芽孢桿菌， 占全部登記產(chǎn)品的 65.9％（含復(fù)合菌種產(chǎn)品）， 其次是膠質(zhì)類芽孢桿菌 （ 23.2％ ）、解淀粉芽孢桿菌 （ 18.5％ ）、 地衣芽孢桿菌（ 17.9％ ）和巨大芽孢桿菌 （ 9.0％ ）。上述 5 種菌屬于芽孢桿菌屬和類芽孢桿菌屬， 是目前國(guó)際上公認(rèn)的植物根際促生菌， 已廣泛應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。除了上述占主導(dǎo)的 5 種菌之外， 有 326 個(gè)登記產(chǎn)品（復(fù)合）使用了其他功能菌， 占比 17.4％ ， 其中， 109 個(gè)產(chǎn)品未使用上述 5 種功能菌， 僅占比 5.8％ 。

細(xì)菌類生產(chǎn)用菌種除常見的芽孢桿菌屬和類芽孢桿菌屬菌種外， 還首次出現(xiàn)了高地芽孢桿菌、 類干酪乳桿菌、 屎腸球菌、 鹽居固氮菌等新菌種， 其中， 高地芽孢桿菌和鹽居固氮菌普遍存在于土壤環(huán)境中， 未見致病性報(bào)道， 屬風(fēng)險(xiǎn)一級(jí)； 類干酪乳桿菌又名為副干酪乳桿菌， 雖為風(fēng)險(xiǎn)一級(jí) ， 但有從動(dòng)物受傷部位分離到該菌的報(bào)道；屎腸球菌屬于乳酸菌類， 但是在一定條件下可致感染， 屬風(fēng)險(xiǎn)二級(jí)， 建議謹(jǐn)慎使用。伯克霍爾德氏菌是一些具有生物防治、 促進(jìn)植物生長(zhǎng)和生物修復(fù)等功能的細(xì)菌， 但同時(shí)也是可以引起鼻疽、 類鼻疽病的致病菌， 因此真菌伯克霍爾德氏菌屬于風(fēng)險(xiǎn)三級(jí)， 需做致病性試驗(yàn)， 建議慎用或不用。真菌類生產(chǎn)用菌株主要為絲狀真菌和酵母菌。哈茨木霉、 米曲霉、 淡紫紫孢菌、 長(zhǎng)枝木霉、 綠色木霉、 棘孢木霉、 黑曲霉、 粉紅螺旋聚孢霉、 金龜子綠僵菌等屬于生物安全風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)二級(jí)， 需按照NY/T 1109－2017 《微生物肥料生物安全通用技術(shù)準(zhǔn)則》 進(jìn)行毒理學(xué)測(cè)試。酵母菌主要以釀酒酵母為主， 還有少量東方伊薩酵母、 季也蒙邁耶氏酵母、 杰丁塞伯林德納氏酵母 （原產(chǎn)朊假絲酵母、 杰丁畢赤酵母）、 膜醭畢赤酵母、 解脂耶羅威亞酵母等， 屬于生物安全風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)一級(jí)， 可免做毒理學(xué)試驗(yàn)。但是熱帶假絲酵母和近平滑假絲酵母亦稱為熱帶念珠菌和近平滑念珠菌， 均為條件致病菌， 醫(yī)學(xué)臨床研究發(fā)現(xiàn)， 多數(shù)念珠菌可引起急性、 亞急性或慢性感染等常見的真菌病。熱帶假絲酵母和近平滑假絲酵母屬于生物安全風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)四級(jí)， 列為禁止使用的菌種。放線菌類生產(chǎn)用菌株多為鏈霉菌屬， 其中細(xì)黃鏈霉菌和弗氏鏈霉菌屬于生物安全風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)一級(jí) ；灰紅鏈霉菌、 婁徹鏈霉菌、 白色鏈霉菌、 天青鏈霉菌、 酒紅土褐鏈霉菌、 灰螺鏈霉菌、 不吸水鏈霉菌和委內(nèi)瑞拉鏈霉菌等屬于生物安全風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)二級(jí)，需要做毒理學(xué)試驗(yàn)。部分企業(yè)使用的諾卡氏菌和擬諾卡氏菌也屬于放線菌， 但為條件致病菌， 可引起人和動(dòng)物的諾卡氏菌病， 通過感染皮膚和內(nèi)臟，引起急性、 慢性或化膿性病癥， 風(fēng)險(xiǎn)三級(jí)， 需做致病性試驗(yàn)， 建議慎用或不用。